作物的根是要进行呼吸作用的，如果土壤通气不良，氧气不足的话，作物根系的呼吸作用就受抑制，进而削弱根系吸收水肥的功能。据试验，当土壤中氧气供应不足时，第一天作物相对的蒸腾量就大减：烤烟减70％，玉米减40％。

由于水肥吸收受障碍，首先就影响根系的生长：旱作物在氧气不足的情况下，根短，色暗，根毛少，甚至引起根系腐烂；水稻若长期渍水，土壤氧气不足，还原性强，也会产生黑根烂根。当然，不同的作物对氧气的要求也不一样。例如，大麦幼苗在土壤含氧量为9.5％时，生长就大受影响，而水稻幼苗则在3％时仍正常生长。

但是，这只说明各种作物对氧的需要量有一定的差异而已。任何一种作物，只要它要求的氧气量得不到满足，其生长都将深受影响，缺的越严重受害越大。 土壤的通气状况，对土壤中一系列的物理、化学与生物过程都产生很大的影响，尤其对微生物的影响更为明显。

在通气不良的情况下，嫌气性微生物占优势，有机质以嫌气分解为主，不但分解速度慢，释放有效养分少，而且还形成一些对作物有害的还原性物质，如硫化氢，低价铁锰和有机酸等。如果土壤通气过强（如旱地的粗砂土），则好气性微生物占绝对优势，有机质分解强烈，影响土壤有机质的适当积累。所以，

土壤的通气状况，确实是即影响作物生长，又影响土壤肥力。